Не сте си прочели условието хубаво. Ако годишната оценка е по-малка от 4.00, ученикът повтаря класа, а не ако общия му успех е по-голям или равен на 4.00 да завърши успешно.

namespace SandBox
{
    using System;

    public class EntryPoint
    {
        public static void Main()
        {

            string nameOfStudent = Console.ReadLine();
            double graduationMarks = 1;
            double totalSum = 0.0;

            while (graduationMarks <= 12)
            {
                double mark = double.Parse(Console.ReadLine());

                if (mark >= 4.0D)
                {
                    graduationMarks++;
                    totalSum += mark;
                }
            }

            double avgSum = totalSum / 12;

            Console.WriteLine($"{nameOfStudent} graduated. Average grade: {avgSum:F2}");
        }
    }
}