Привет,

Не съм разглеждал решението ти в детайли.
Просто го пуснах в Judge и видях, че имаш проблеми при пунктуацията. Реално не я премахваш.

Във функцията ти 

std::vector<std::string> removePunctsFromInput(std::string& input) {

size_t inputSize = input.size();
for (size_t i = 0; i < inputSize; i++)
{
	if (ispunct(input[i]))
	{
		input.erase(i, 1);
		inputSize--;
	}
}

е грешно.

Реално сме учили, че итерацията и триенете едновременно е ... tricky.
erase метода инвалидира итератора като връща резултат новия update-нат итератор.
Ти никъде не го запомняш и ... бум. Респективно инкрементирането на брояча също е по-различно.
 

//                                        no increment here
//                                              ||
//                                              \/
for (auto it = input.begin(); it != input.end(); ) {
  if (ispunct(*it)) {
    it = input.erase(it);
  } else {
    ++it; //nornal update
  }
}

Не знам дали имаш други проблечи в задачата.
Това видях на прима виста.

Поздрави