Този регекс маха и кавичките:

string text = Console.ReadLine();
string pattern = @"<a\s+href=(\""|\')([^>]+)\1>([^>]+)<\/a>";
Regex regex = new Regex(pattern);
string replacement = "[URL href=$2]$3[/URL]";
string result = Regex.Replace(text, pattern, replacement);
Console.WriteLine(result);

 *** начин  

string text = Console.ReadLine();

        var regex1 = new Regex(@"<a");
        var regex2 = new Regex(@">");
        var regex3 = new Regex(@"(<\/a>)");
        var regex4 = new Regex(@"(<a)(.+)(>)(\w+)(<\/a>)");       
        bool condition = (regex4.IsMatch(text));
        if(condition==true)
        {
                string variableText = regex1.Replace(text, "[URL");
                text = variableText;
                text = regex3.Replace(text, "[/URL]");
                variableText = text;
                variableText = regex2.Replace(text, "]");
                text = variableText;
                Console.WriteLine(text); 
     
        }

        else
        {
            Console.WriteLine(text);
        }