Runtime Error значи че получаваш Exception или по точно IndexOutOfRangeException (излизаш от рамките на масива).
Можеш да го оправиш като във втория цикъл който завърташ промениш условието на :

for (int i = 0; i < input.Count -1; i++)

Така си сигурен, че  j = (i+1) няма да излезе от размера на масива.

Проблемът е, че на втори ред може да се подадат като вход повече от едно числа. 

Ако сплитнеш втория ред по спейс, няма да гърми :)

А от къде взе условието на задачата? Аз не го намирам...

А ще може ли да кажеш откъде намери условието на задачата, защото аз не мога да го намеря. В джъдж системата има задачи за решаване, а няма условия, в инстанцията на курса няма нищо по тази тема. Търсих стари инстанции и пак нищо не намерих.

Онзи ден реших да реша някоя задача от programming fundamentals в джъдж, за да видя какво учат сега новите студенти и след половин час търсене на условия без успех, се отказах. Не мога да разбера какъв е смисъла да има задачи за решаване в джъдж, а да няма условия за тях.

Колеги, оправили са тестовете на задачата. Вече си минава със 100/100. :)