Имаш if в чието условие сравняваш променливи, които получават стойност, различна от 0, само при влизане в други if-ове преди това. Изнеси сметките за двете стипендии отгоре - при самото им деклариране - те са си толкова, без значение дали ученикът ги взима или не.

Пък и проверките за това коя стипендия се взима, ми се струват малко в горния код. Може и да не са, но всичко, което трябва да се покрие в задачата, е следното:

1) Четене на входните данни.

2) Изчисляване на стипендиите. Без значение дали ще взима социална стипендия, стипендия за успех или никакви, си е задедено, че социалната е 0.35 * минималната заплата, а стипендията за успех е успехът *25. Това спокойно можеш да си го сложиш в две променливи - социална стипендия и стипендия за успех. И после да ги използваш за сравняване или печатане на конзолата.

3) Проверка за успех по-малък или равен на 4.50 - принтира се, че няма стипендия.

4) При успех по-голям от 4.50 - вложени проверки за:

4.1.)  доход по-голям или равен на минималната заплата и успех под 5.50 - няма стипендия.

4.2.) доход по-голям или равен на минималната заплата и успех по-голям или равен на 5.50 - стипендия за успех.

4.3.) доход по-малък от минималната заплата и успех под 5.50 - социална стипендия.

4.4.) доход по-малък от минималната заплата и успех по-голям или равен на 5.50 - вложена проверка за това коя стипендия е по-голяма и принтиране на съответния резултат.

Това покрива всички случаи.

И пробвай с Math.Truncate. Math.Floor май не вършеше работа при тази задача.

EDIT: Ето го и като код. C# е, но ще се ориентираш: https://pastebin.com/fbGPHArh

Ето едно по-подровно решение на C#,  в което случеите са описани по-подробно и четливо

using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;
using System.Text;
using System.Threading.Tasks;

namespace Scholarship
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            double income = double.Parse(Console.ReadLine());
            double grades = double.Parse(Console.ReadLine());
            double minSalary = double.Parse(Console.ReadLine());

            double socialScholarship = 0.35 * minSalary;
            double gradesScholarship = 25 * grades;

            if (income<=minSalary && grades>=5.50)
            {
                if (socialScholarship>gradesScholarship)
                {
                    Console.WriteLine($"You get a Social scholarship {Math.Floor(socialScholarship)} BGN");
                }
                else
                {
                    Console.WriteLine($"You get a scholarship for excellent results {Math.Floor(gradesScholarship)} BGN");
                }
            }
            else if (income>minSalary&&grades>=5.50)
            {
                Console.WriteLine($"You get a scholarship for excellent results {Math.Floor(gradesScholarship)} BGN");
            }
            else if (income<=minSalary && grades>=4.50)
            {
                Console.WriteLine($"You get a Social scholarship {Math.Floor(socialScholarship)} BGN");
            }
            else if (income<=minSalary&&grades<4.50)
            {
                Console.WriteLine("You cannot get a scholarship!");
            }
            else if (income>minSalary&&grades<5.50)
            {
                Console.WriteLine("You cannot get a scholarship!");
            }

        }
    }
}