Shift-a е най-вероятно едната ти грешка както колегата каза, другата е в Contains-a:

int num = int.Parse(split[1]);
if (num >= 0 && num <= numbs.Count - 1)

Този If e абсолютно ненужен, наличието на даден елемент в листа не зависи по никакъв начин от броя елементи в листа.
Също така:

contain += i + "|";
string[] contSpl = contain.Split('|');

Тези 2 реда ще те доведат до много неприятности, защото в този сплит си забравил StringSplitOptions.RemoveEmptyEntries, така че string-a "1|" като се сплитне дава 2 елемента = "1" и "". По адекватният вариант е според мене веднага още в Contains командата да изпечатваш резултата на екрана вместо да чакаш до принт командата.

За грешките е това, ето ти няколко съвета за оптимизации обаче ако ти е интересно:

for (int i = int.Parse(split[1]); i < (split.Length - 2) + int.Parse(split[1]); i++)

Лоша идея е да имаш операции в условието на цикъл, понеже то ще се проверява при всяко завъртане на цикъла, това ще доведе до много излишни операции (всеки път ще изваждаш 2 от split.Length-a, parse-ваш split[1] и след това ги събираш). Тъй като резултата от условието ще е абсолютно еднакъв всеки път е по добре да извадиш смятането му преди цикъла и просто да сложиш резултата там.

За sumPairs-a бих ти препоръчал друг подход, RemoveAt е реално много скъпа команда, ако имаме 100 000 елемента в листа и искаме да махнем 2рият, то другите 99 998 след него трябва да се преместят с една позиция наляво. Понеже знаем че ще събираме всеки 2 елемента, по адекватно ще е да направим един нов лист и да записваме резултатите в него, след което просто да подменим старият лист с новият, по този начин може да избегнем всичките remove-вания.